Cited 0 times in Scipus Cited Count

CGV : Cancer Genome View, a Shiny/R application for cancer genome data analysis and visualization

DC Field Value Language
dc.contributor.author이, 지혜-
dc.date.accessioned2021-01-06T02:34:21Z-
dc.date.available2021-01-06T02:34:21Z-
dc.date.issued2020-
dc.identifier.urihttp://repository.ajou.ac.kr/handle/201003/19189-
dc.description.abstract비공개-
dc.description.tableofcontents제 1장 서론 1
제 2장 구축 5
2-1. Infrastructure 5
2-2. 다중 오믹스 데이터 구조화 및 데이터베이스 구축 6
2-3. 유전자 집합 데이터베이스 구축 9
2-4. 분석 및 시각화 기능 구축 12
제 3장 결과 13
3-1. CGV 분석 플랫폼 13
3-2. CGV 분석 단계 15
3-2-1. 데이터 불러오기 (Data Load) 15
3-2-2. 샘플 선택 (Sample Selection) 17
3-2-3. 특징 선택 (Feature Selection) 25
3-2-4. 분석 및 시각화 27
(1) 유전자 집합 농축 분석 (Gene set enrichment analysis) 27
(2) 생존 분석 (Survival analysis) 27
(3) 서열변이 분석 27
3-3. 사례 연구 29
3-3-1. 병리학적 단계로 나눈 LIHC 샘플의 생존 분석 29
3-3-2. 병합된 데이터에서의 유전자 세트 농축 점수 분석 38
3-3-3. BRCA 샘플을 이용한 서열변이 분석 41
제 4장 고찰 49
제 5장 결론 51
참고문헌 52
영문 요약 60
-
dc.language.isoko-
dc.titleCGV : Cancer Genome View, a Shiny/R application for cancer genome data analysis and visualization-
dc.title.alternativeCGV : Cancer Genome View, 암 유전체 데이터 분석 및 시각화를 위한 Shiny / R 응용 프로그램-
dc.typeThesis-
dc.identifier.urlhttp://dcoll.ajou.ac.kr:9080/dcollection/jsp/common/DcLoOrgPer.jsp?sItemId=000000029533-
dc.subject.keywordTCGA-
dc.subject.keywordGene set-
dc.subject.keywordgenomic analysis-
dc.subject.keywordmulti-omics-
dc.subject.keywordweb-based platform-
dc.subject.keyword유전자 집단-
dc.subject.keyword유전체분석-
dc.subject.keyword다중 오믹스-
dc.subject.keyword웹 기반 플랫폼-
dc.description.degreeMaster-
dc.contributor.department대학원 의생명과학과-
dc.contributor.affiliatedAuthor이, 지혜-
dc.date.awarded2020-
dc.type.localTheses-
dc.citation.date2020-
dc.embargo.liftdate9999-12-31-
dc.embargo.terms9999-12-31-
Appears in Collections:
Theses > Graduate School of Biomedical Sciences > Master
Files in This Item:
There are no files associated with this item.

qrcode

해당 아이템을 이메일로 공유하기 원하시면 인증을 거치시기 바랍니다.

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.

Browse