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CGV : Cancer Genome View, a Shiny/R application for cancer genome data analysis and visualization
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | 우, 현구 | - |
| dc.contributor.author | 이, 지혜 | - |
| dc.date.accessioned | 2021-01-06T02:34:21Z | - |
| dc.date.available | 2021-01-06T02:34:21Z | - |
| dc.date.issued | 2020 | - |
| dc.identifier.uri | http://repository.ajou.ac.kr/handle/201003/19189 | - |
| dc.description.abstract | 비공개 | - |
| dc.description.tableofcontents | 제 1장 서론 1
제 2장 구축 5 2-1. Infrastructure 5 2-2. 다중 오믹스 데이터 구조화 및 데이터베이스 구축 6 2-3. 유전자 집합 데이터베이스 구축 9 2-4. 분석 및 시각화 기능 구축 12 제 3장 결과 13 3-1. CGV 분석 플랫폼 13 3-2. CGV 분석 단계 15 3-2-1. 데이터 불러오기 (Data Load) 15 3-2-2. 샘플 선택 (Sample Selection) 17 3-2-3. 특징 선택 (Feature Selection) 25 3-2-4. 분석 및 시각화 27 (1) 유전자 집합 농축 분석 (Gene set enrichment analysis) 27 (2) 생존 분석 (Survival analysis) 27 (3) 서열변이 분석 27 3-3. 사례 연구 29 3-3-1. 병리학적 단계로 나눈 LIHC 샘플의 생존 분석 29 3-3-2. 병합된 데이터에서의 유전자 세트 농축 점수 분석 38 3-3-3. BRCA 샘플을 이용한 서열변이 분석 41 제 4장 고찰 49 제 5장 결론 51 참고문헌 52 영문 요약 60 | - |
| dc.language.iso | ko | - |
| dc.title | CGV : Cancer Genome View, a Shiny/R application for cancer genome data analysis and visualization | - |
| dc.title.alternative | CGV : Cancer Genome View, 암 유전체 데이터 분석 및 시각화를 위한 Shiny / R 응용 프로그램 | - |
| dc.type | Thesis | - |
| dc.identifier.url | http://dcoll.ajou.ac.kr:9080/dcollection/jsp/common/DcLoOrgPer.jsp?sItemId=000000029533 | - |
| dc.subject.keyword | TCGA | - |
| dc.subject.keyword | Gene set | - |
| dc.subject.keyword | genomic analysis | - |
| dc.subject.keyword | multi-omics | - |
| dc.subject.keyword | web-based platform | - |
| dc.subject.keyword | 유전자 집단 | - |
| dc.subject.keyword | 유전체분석 | - |
| dc.subject.keyword | 다중 오믹스 | - |
| dc.subject.keyword | 웹 기반 플랫폼 | - |
| dc.description.degree | Master | - |
| dc.contributor.department | 대학원 의생명과학과 | - |
| dc.contributor.affiliatedAuthor | 이, 지혜 | - |
| dc.date.awarded | 2020 | - |
| dc.type.local | Theses | - |
| dc.citation.date | 2020 | - |
| dc.embargo.liftdate | 9999-12-31 | - |
| dc.embargo.terms | 9999-12-31 | - |
- Appears in Collections:
- Theses > Graduate School of Biomedical Sciences > Master
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